Patrocinada en 1564 por Pedro de la Gasca, Virrey del Perú y posteriormente obispo de Palencia y de Sigüenza. Su reconstrucción se inició en 1566 a partir de planos de Rodrigo Gil de Hontañón y en ella se respetó la Capilla de los Corrales.

El templo es una nave de cinco cuerpos con bóveda de crucería decorada con las armas del patrón. Fue concebido como un gran mausoleo del patrono, quién se reservó la capilla mayor para su enterramiento, muestra de ello es la presencia de su gigantesco escudo en la portada y una leyenda que rodea todo el interior del templo recordando su obra.

La fachada renacentista de piedra es rectangular y esbelta, con doble portada en arco de medio punto y hornacina superior con una escultura de La Magdalena del s.XVII. Como ya se comento, la fachada está dominada por un enorme escudo del patrono.

En el lado del Evangelio, se puede apreciar la torre campanario, realizada en ladrillo.

El sepulcro, situado en el centro del templo, es un bulto en alabastro que representa al obispo yacente, obra de Esteban Jordán.

Patrimonio Artístico

- Retablo Mayor .-

Obra de Esteban Jordán., 1575, consta de tres cuerpos y ático. El motivo central es un relieve de La Traslación de María Magdalena, flanqueado por las esculturas de los apóstoles: San Pedro y San Pablo, a un lado y San Felipe y Santiago al otro. En el segundo cuerpo podemos apreciar los relieves: La Transfiguración, La Epifanía y Venida del Espíritu Santo.. En el tercer cuerpo se aprecian los relieves: La Resurrección, Los Discípulos de Emaús y La Magdalena ungiendo los pies de Cristo. El ático está adornado por La Piedad y El Calvario, flanqueados por los escudos del patrono.

A ambos lados del Retablo Mayor están representados los dos ladrones en pintura.

- Crucero .-

En el crucero se observan dos retablos, uno barroco: Retablo del Cristo del Perdón, con figura procesional dramática obra de Bernardo Rincón de 1656 realizado para la Cofradía de la Pasión, y el segundo: Retablo de Santiago, con relieve de Santiago Matamoros de Esteban Jordán.

LADO DEL EVANGELIO

- Capilla del Cristo de las Batallas (1ª) .-

Con imagen de Fco. Rincón.

- Retablo de La Virgen de los Remedios .-

Barroco del 1676, con las pinturas de los hermanos Felipe y Manuel Gil de Mena.

LADO DE LA EPISTOLA

- Retablo del Cristo del Sepulcro .-

De inicios del s.XVIII. Procedente del desaparecido Hospital de la Resurrección, en el que podemos contemplar cristos yacentes barrocos.

- Retablo de la Quinta Angustia .-

Barroco del año 1500, con un magnífico grupo escultórico de Alejo de Vahía. Se encuentra al lado del Presbiterio.

- Capilla del Dr. Corral .-

con reja plateresca. Es doble, la primera estancia es cuadrada y guarda el Retablo de la Virgen de la Salve del s.XVIII, la segunda estancia corresponde a la Capilla de Los Corrales, construida en 1538, único resto de la anterior iglesia antes de su reconstrucción, en la cual se conserva la mejor obra del templo: un retablo plateresco policromado obra de Fco. Giralte, de mitad del s.XVI. Ademas se puede observar una inscripción que indica que fue edificada a expensas de D. Luis Sanz del Corral, confesor del Emperador y su esposa.